GDAL_PAM_ENABLED=NO

tools/productListToNDVI.sh

@@ -5,55 +5,59 @@ OUTDIR=$2
 WINDOW=$3
 count=1
 ext=.jpg
-cd $BASEDIR
-for f in $(find . -type f -name '*.zip')
-do 
+BOX=$(python3 "$HOME/git/GeoSentinel/geosentinel/polygonToBox.py" "$3")
+echo $BOX
 
-	filepattern=$(echo $f | cut -d"_" -f6)"_"$(echo $f | cut -d"_" -f3)"_B"
-	filename=$OUTDIR$filepattern
-	echo $filename
-	if [ ! -e $filename"04.jp2" ]; then
+#cd $BASEDIR
 
-                unzip -n -j $f *B04.jp2 -d $OUTDIR 
-	fi
+#for f in $(find . -type f -name '*.zip')
+#do 
 
-	if [ ! -e $filename"08.jp2" ]; then
+#	filepattern=$(echo $f | cut -d"_" -f6)"_"$(echo $f | cut -d"_" -f3)"_B"
+#	filename=$OUTDIR$filepattern
+#	echo $filename
+#	if [ ! -e $filename"04.jp2" ]; then
 
-		unzip -n -j $f *B08.jp2 -d $OUTDIR 
-	fi
+#                unzip -n -j $f *B04.jp2 -d $OUTDIR 
+#	fi
 
+#	if [ ! -e $filename"08.jp2" ]; then
 
-	cd $OUTDIR
-	NIR=$(ls $filepattern"08.jp2" -t |head -1)
-	VIR=$(ls $filepattern"04.jp2" -t |head -1)
+#		unzip -n -j $f *B08.jp2 -d $OUTDIR 
+#	fi
 
-	echo "NIR-"$NIR
-	echo "VIR-"$VIR
+#	
+#	cd $OUTDIR
+#	NIR=$(ls $filepattern"08.jp2" -t |head -1)
+#	VIR=$(ls $filepattern"04.jp2" -t |head -1)
 
-	if [ ! -d "ndvi" ]; then
-		mkdir ndvi
-	fi
+#	echo "NIR-"$NIR
+#	echo "VIR-"$VIR
 
-	fileout1=$(echo $filepattern | cut -d"_" -f1)
-        fileout2=$(echo $filepattern | cut -d"_" -f2)
+#	if [ ! -d "ndvi" ]; then
+#		mkdir ndvi
+#	fi
 
-	if [ ! -e ndvi/$fileout2"_"$fileout1".tiff" ]; then
-		python3 $HOME/git/GeoSentinel/geosentinel/ndvi.py $NIR $VIR ndvi/$fileout2"_"$fileout1".tiff"
-	fi
+#	fileout1=$(echo $filepattern | cut -d"_" -f1)
+#        fileout2=$(echo $filepattern | cut -d"_" -f2)
 
-        if [ ! -d "video_ndvi" ]; then
-                mkdir video_ndvi
-        fi
-	echo $3
-#	BOX=$(python3 "$HOME/git/GeoSentinel/geosentinel/polygonToBox.py" "$3")
-#	echo $BOX
-#	set GDAL_PAM_ENABLED=NO
-#	gdal_translate -projwin $BOX -projwin_srs WGS84 -ot Byte -scale 0 255 0 255 -of JPEG ndvi/$fileout2"_"$fileout1".tiff" video_ndvi/$fileout2"_"$fileout1".jpg"
-#	set GDAL_PAM_ENABLED=YES
-	cd ..
+#	if [ ! -e ndvi/$fileout2"_"$fileout1".tiff" ]; then
+#		python3 $HOME/git/GeoSentinel/geosentinel/ndvi.py $NIR $VIR ndvi/$fileout2"_"$fileout1".tiff"
+#	fi
 
-done
-cd $OUTDIR"/video_ndvi"
-ffmpeg  -i %*.jpg -c:v libx264 -vf fps=10 -pix_fmt yuvj422p out.mp4
+#        if [ ! -d "video_ndvi" ]; then
+#                mkdir video_ndvi
+#        fi
+#	echo $3
+##	BOX=$(python3 "$HOME/git/GeoSentinel/geosentinel/polygonToBox.py" "$3")
+##	echo $BOX
+##	set GDAL_PAM_ENABLED=NO
+##	gdal_translate -projwin $BOX -projwin_srs WGS84 -ot Byte -scale 0 255 0 255 -of JPEG ndvi/$fileout2"_"$fileout1".tiff" video_ndvi/$fileout2"_"$fileout1".jpg"
+##	set GDAL_PAM_ENABLED=YES
+#	cd ..
+
+#done
+#cd $OUTDIR"/video_ndvi"
+#ffmpeg  -i %*.jpg -c:v libx264 -vf fps=10 -pix_fmt yuvj422p out.mp4